Автоматизированная система классификации химических соединений по биологической активности: научные принципы, основы технологии, элементы техники

Для оценки биологической активности ХС по его физическим, химическим и физикохимическим показателям широко применяются методы, основанные на поиске статистической зависимости (корреляции) между этими показателями и биологической активностью. Фактически при поиске такой корреляции используется регрессионный анализ1. Получаемые при этом уравнения, связывающие структурные показатели с биологической активностью, обычно в литературе называют корреляционными или регрессионными уравнениями типа структура…

Полученные сведения о спектральных свойствах оливомицина и структуре его комплекса с ионами магния позволили непосредственно перейти к изучению механизма реакции взаимодействия комплекса оливомицин — Mg2+ с ДНК. В форме комплекса с Mg2+ антибиотик взаимодействует с ДНК, при этом интенсивность флуоресценции возрастает и в ее спектре возникает новая полоса, обусловленная характером микроокружения хромофора оливомицина в малом…

Особенно большие трудности в проблеме оценки биологической активности ХС по физико-химическим характеристикам возникают в том случае, когда реализация биологической активности ХС — многоэтапный процесс. В качестве примера, иллюстрирующего трудности интерпретации физико-химических особенностей поведения молекулы для оценки ее активности, рассмотрим результаты изучения взаимодействия противоопухолевого антибиотика оливомицина и ДНК. Эти результаты были получены путем комплексного применения высокочувствительных,…

Проблемы оценки биологической активности ХС по физико-химическим характеристикам. В общем следует заметить, что предсказание потенциальной биологической активности, а тем более мишени для ХС с известной структурой и физико-химическими свойствами — проблема достаточно сложная. Наиболее простой случай, когда исследователь имеет ряд соединений с близкой структурой. Естественно, что физические, химические и физико-химические свойства таких соединений будут близки….

Пассивная диффузия может проходить через толщу мембраны и через каналы в ней. Структура каналов точно не определена. Возможно, за каналы принимаются определенные векторные процессы. Через каналы преимущественно проходят ионы Na+ и К+, однако многие вещества, представляющие катионы с ОН- и NН2-группами, также идут через каналы, например, гидроксиламин H3N+-OH и гидразин H3N+-NH2 проходят через Na-канал (Волькенштейн,…

Наличие в клетке разветвленной эндоплазматической сети из мембран, заполненной внутри особо организованной водной фазой, дает возможность некоторым веществам перемещаться в этих внутренних каналах путем диффузии в водной среде, достигая даже клеточного ядра. Как пишут Лёви и Сикевиц (1971), малая молекула «пропутешествовала бы через клетку, ни разу не преодолевая мембранного барьера» (с. 67). Очевидно, это замечание…

Вещества, попадая во внутреннюю внеклеточную среду организма, могут связывать, конечно, не только растворенные газы, но любые другие ионы и молекулы: ионы щелочных и щелочно-земельных металлов, молекулы биологического происхождения (например, холестерин, стероидные гормоны, определенные белки и т. д.). Спектр видов биологических активностей в этом случае может быть весьма широк — от противосвертывающей или, напротив, свертывающей до…

С позиций клеточной морфологии все ХС целесообразно разделить на пять групп исходя из топографического положения их мишени (рецептора): ХС, действующие на рецепторы, находящиеся над клеточной мембраной; ХС, действующие на клеточную мембрану; ХС, действующие на мишени внутри клетки, т. е. проникающие за клеточную мембрану; ХС, действующие одновременно по 1, 2 и 3-му типам или по 1-му,…

Наиболее полный современный обзор данных о физических и химических свойствах веществ, используемых для получения количественных соотношений структура—активность, принадлежит С. В. Нижнему и Н. А. Эпштейну (1978). На основании анализа около 230 литературных источников авторы составили таблицу, куда вошли около 40 различных физических, химических и физико-химических показателей ХС и перечень различных видов биологической активности, которые связаны…

Принцип попадания Представленные выше литературные данные показывают, что в подавляющем большинстве случаев биологическая активность ХС коррелирует с его способностью определенным образом распределяться между липидной и водной фазами. Естественно, что такая же корреляция наблюдается с теми физическими и химическими показателями, которые по природе своей связаны с коэффициентом распределения. Так, например, Г. Т. Фрумин и Т. С….

Анализируя биологическое действие большого числа химических соединений, Лазарев пришел к следующим основным выводам. Сила неспецифического действия неэлектролитов на различные биологические объекты возрастает с увеличением номера группы, т. е. с увеличением растворимости в неводной фазе. С увеличением номера группы и величины Ком растворимость в воде уменьшается быстрее, чем растет сила неспецифического биологического действия. Поэтому способность неэлектролитов…

Заметной работой, развивающей основные идеи Н. В. Лазарева, явилась книга А. А. Голубева и др. (1973). В этой монографии, в частности, подробно изложена и проанализирована работа двух соавторов данной монографии В. А. Филова и Е. И. Люблиной (1965, см. также: Filov, 1976), в которой токсические свойства 218 органических соединений корреляционно связывались с 38 физическими и…