3 октября 2012

Выбор тест-объектов и их характеристик

Принцип представительности базы и надстройки

Основные свойства пространства БАХС, цели, ради которых следует изучать это пространство, принципы классификации видов и, наконец, общие черты структуры системы классификации позволяют сформулировать правила выбора тест-объектов и их характеристик. Рассмотрим этот вопрос подробнее для базы, надстройки, механизменных моделей и расчетных методов.

Вначале мы проанализируем идеальный вариант, отвлекаясь от технических аспектов. В последующем изложении рассмотрим технологические требования и ограничения, а также возможности развития классификационной системы по реальной технологии.

Напомним, что база должна пропускать весь массив ХС (порядка 5 — 10Х104 веществ в год), выдавая для каждого из них единообразный набор характеристик — основной «биологический паспорт» ХС.

Эти характеристики должны в совокупности описать на избранном уровне деятельности действие вещества на клетку с учетом основных таксономических ее вариаций. Именно при выполнении этих условий можно говорить о том, что в базу «заложены модели» клетки и биосферы, пусть в самом огрубленном виде.

Описание биологической активности ведется на языке ОВБА, что, по существу, однозначно задает те характеристики, которые следует определять при действии ХС на клетку. Ранее в этой части отмечалось, что биологическая активность вещества зависит от способа введения ХС в объект и наличия дополнительных воздействий. Для учета этих принципиальных особенностей необходимо определять зависимости основных характеристик ХС от концентрации С и времени его воздействия t1.

Желательно также ввести в систему дополнительные стандартные воздействия. Таким образом, можно дать перечень определяемых в базе системы классификации φni (С, t) функций в следующем виде: индекс n пробегает значения от 1 до 27 в соответствии с номенклатурой ОВБА, изложенной выше.

Смотрите — Общая характеристика системы классификации

1Такое представление зависимости некоторой характеристики тест-объекта от дозы и времени действия ХС мы будем называть φni (С, t) функцией.

Для точного обозначения ср могут быть введены индексы, соответствующие номеру тест-объекта и номеру измеряемой характеристики. Например, символы φni (С, t) обозначают, что для клеток 1-го типа (например, простейших) определяется кинетика концентрационного влияния ХС на определенную реакцию n-типа (например, адаптационную).


«Биологически активные вещества»,
Г.М.Баренбойм, А.Г.Маленков



Эвристический анализ является мощным способом разработки алгоритма и в отношении «старых» видов биологической активности, и в отношении новых, для которых еще не найдены хорошие вещества, но особенно он ценен, конечно, в отношении именно новых видов активности. Пока нет, например, веществ, обладающих хорошей противовирусной активностью. Можно ожидать ее от веществ, обладающих выраженной тропностью к двухтяжевым РНК,…

Очевидно, что исходная совокупность свойств, которые должны эпиморфно проектироваться среди все усложняющихся объектов, определяется заранее экспериментатором в зависимости от поставленной задачи. По этой совокупности далее и формируются графы моделей. По принципу отбора этих свойств формируемые графы могут быть разделены на три группы. Первая группа основана на эпиморфной проекции общебиологических свойств (рост, деление, дыхание, движение и…

Принцип эпиморфизма определяет выбор многих тест-объектов и их характеристик. Этот принцип позволяет во многих случаях прямо найти переводы с языка ОВБА на языки интегральных видов активности. Однако нахождение эпиморфных моделей организма ограничено часто нашими знаниями. Для большинства патологий клеточно-тканевые (да часто и вообще любые) модели пока неизвестны. Кроме того, очевидно, что иметь эпиморфные модели для…

Общие соображения Основным языком всей системы является язык ОВБА. Это язык представительных наборов моделей клетки, организма человека и биосферы. При построении модели человека использовано гистогенетическое его представление. В надстройку системы классификации введены дополнительные тест-объекты, более детально представляющие разновидности ткани организма. Эти тест-объекты являются элементами представительной модели организма, поэтому ответы, которые они дают, непременно выражаются на…

Несмотря на общность клеточного строения и основных биохимических процессов в мире живого, реальные цитологические, биохимические и молекулярные развития между представителями различных типов, классов, отрядов, семейств, родов и видов столь значительны, что избирательность действия химических соединений, как правило, очень велика. Существует множество примеров такого избирательного действия: так, молекулы фосфорорганических инсектицидов в организме насекомого превращаются в другое,…