Bader и Ray (1976), исследовав РНК MuLV, RSV и вируса RD114, пришли к заключению, что их результаты не противоречат предположению о наличии двух субъединиц в состав 70S РНК.
Вместе с тем эти данные позволили предложить мономерную модель, в которой как исходная 70S РНК, так и промежуточные и конечные продукты ее денатурации представляют собой конфигурационные варианты одной и той же молекулы.
До сих пор остается неясной биологическая целесообразность «созревания» 60 — 70S РНК из 30 — 40S-cyб-единиц, являющихся предшественниками высокомолекулярной РНК. Показано, что РНК из вирионов «быстрого урожая» (через несколько часов после выхода) представлена в основном 35 — 375-субъединицами, а РНК из популяции вирионов при длительной инкубации в среде состоит из 70S РНК. Предполагают, что этот процесс формирования в вирионе высокомолекулярной 60 — 70S РНК осуществляется какими-то ферментными системами вирусной частицы.
Интересно, что в непермиссивных условиях и при хронической инфекции в ряде клеточных систем выявлены минимальные формы онкорнавирусов типов А и С (А. Ф. Быковский и др., 1977). Выделенные 6 типов этих форм имеют типичную для онкорнавирусов морфологию и отличаются от них необычайно малыми размерами (их величина 25 — 70 нм, диаметр нуклеотида 10 — 30 нм) и тем, что они включают в вирион только одну субъединицу 30 — 40S РНК или ее отдельные фрагменты.
Патогенные свойства минимальных форм онкорнавирусов пока не доказанн и их биологическая роль до настоящего времени не выяснена.
Итак, с обнаружением нескольких фрагментов в составе вирусного генома сразу же возникло много принципиально новых вопросов, среди которых основным был вопрос о химической и биологической идентичности субъединиц 30 — 40S РНК.
Одним из подходов к исследованию химической однородности субъединиц явилось интенсивно проводимое изучение концевых последовательностей РНК.
Schwartz и соавт. (1977) определили последовательности 20 нуклеотидов в РНК RSV, прилегающих к поли-А-фрагменту на 3´-конце, путем идентификации дезоксинуклеозид-трифосфата, дискриминирующего начало и продолжение обратнотранскриптазной реакции, осуществляемой на матрице вирусной РНК.
Обнаружено, что популяция молекул вирусной РНК состоит из молекул трех типов (если иметь в виду 3´-концевую последовательность нуклеотидов). Различия между молекулами заключаются в последовательностях, непосредственно прилегающих к З´-концу, более удаленные участки у этих молекул оказались одинаковыми.
Первичная структура указанных молекул вирусной РНК формируется следующими последовательностями:
…Г-Ц-Ц-А-У-У-У-У-А-Ц-Ц-А-У-У-Ц-А-поли (А)3´;
…Г-Ц-Ц-А-У-У-У-У-А-Ц-Ц-А-У-У-Ц-А-Ц-Ц-А-поли (А)3´;
…Г-Ц-Ц-А-У-У-У-У-А-Ц-Ц-А-У-У-Ц-А-Ц-Ц-А-Ц-А-поли (А)3´.
В присутствии эндогенной затравки (тРНК-трн), локализованной у 5´-конца вирусного генома, синтезируется ДНК-продукт (strong-stop ДНК), ковалентно связанный с тРНК, длина которого от затравки до 5´-конца матрицы составляет 101 нуклеотид (Haseltine et al., 1977).
После секвенсирования strong-stop ДНК стала известна последовательность 101 основания 5´-конца генома RSV штамм Прага, субгруппа С.
При сопоставлении нуклеотидных последовательностей 3´- и 5´-концов молекулы РНК оказалось, что по крайней мере первые 20 нуклеотидов идентичны последним 20 нуклеотидам и, следовательно, геном RSV имеет на концах повторяющийся участок. Аналогичные данные получены и в отношении вируса миелобластоза птиц (Stoll et al., 1977).
Наличие таких повторяющихся последовательностей делает возможной элонгацию ДНК-продукта по достижении 5´-конца матрицы вследствие образования водородных связей между strong-stop ДНК и комплементарной последовательностью на З´-конце РНК, т. е. циркуляризации молекулы после синтеза strong-stop ДНК и последующего «перескока» ДНК с 5´- к З´-концу молекулы матрицы. Электронно-микроскопические данные, главным образом для онкорнавирусов приматов, свидетельствуют о том, что две субъединицы РНК связаны друг с другом по 5´-концам.
Учитывая установленную нуклеотидную последовательность 3´ и 5´-концов РНК RSV и AMV, предложены две гипотетические модели образования димеров при взаимодействии 5´-концов двух молекул РНК.
Итак, показано, что 5´- и З´-концы генома онкорнавирусов птиц, исключая «закрывающие» структуры — «кэпы» у 5´-конца и поли-А-сегменты у З´-конца, содержат идентичные последовательности длиной в 20 — 21 нуклеотид.
У многих онкорнавирусов определены «кэпы», например, идентифицирован специфический терминальный фрагмент на 5´-конце 35S РНК RSV и MuLV (штамм Молони). Этот фрагмент устойчив к действию нуклеазы, имеет структуру, состоящую из 5´-нуклеозидтрифосфата и рибозы, метилированной в 2´-положении.
К рибозе присоединяется 7-метилгуанозин в 5´-положении через 5´-5´-пирофосфатную связь (7 mG5. ррр5. GmpCp—) (Rose et al., 1976).
Второй подход к изучению однородности субъединиц вирусного генома связан с исследованиями поли-А-фрагментов в его составе.
«Механизмы вирусного онкогенеза»,
А.И.Агеенко