Ограничения метода, трудности, которые встречаются на практике при получении корреляционных уравнений, детально проанализированы М. А. Ландау (1981).
В этой монографии, в частности, автор приводит ряд соображений и конкретных данных, которые помогают выбрать из полученных уравнений наилучшее, упростить задачу получения такого уравнения, так как при большом числе параметров перебрать все возможные варианты практически невозможно, и, наконец, как определить пригодность полученного уравнения для предсказания активности новых соединений.
При использовании обсуждаемого метода в автоматизированной системе классификации наиболее сложная проблема — отнесение тестируемого ХС к определенному ряду. В самом деле, методология Ханча хорошо работает в узких рядах гомологичных соединений. Для каждого такого ряда существует или может быть создано соответствующее уравнение структура — активность.
Но как отнести новое тестируемое соединение к определенному ряду? Для этого должны быть разработаны алгоритмы определения такой принадлежности применительно к классификации ХС по рядам, которая позволяет формировать соответствующие уравнения внутри этих рядов. Для отнесения ХС к общей формуле ряда, для которого есть корреляционное уравнение, может быть разработан алгоритм на основе упомянутого выше коэффициента сходства.
Все методы, использующие показатели, определяемые структурой и названные в этой главе, взаимосвязаны и по своей естественной сути и по цели, связанной с классификацией ХС. Эта связь изображена на рисунке ниже.
Смотрите рисунок и описание к нему — Взаимосвязь некоторых расчетных и экспериментальных методов
БА — биологическая активность; ФКСП — фрагментарный код суперпозиции подструктур химического соединения; ПК — параметры конформации; ЭС — электронная структура. Объяснение в тексте.
В связи с этой схемой следует отметить еще раз, что показатели, характеризующие стерические, электронные и гидрофобные свойства молекулы, могут быть в большинстве случаев получены как расчетными, так и экспериментальными методами.
Во многих случаях можно использовать табличные величины для различных заместителей, следует только иметь в виду, что различный состав соединения, конформация ХС вообще и биологически активная конформация в частности, среда, в которой находится молекула и т. п., могут коренным образом повлиять на стерические и электронные свойства заместителей, что приведет к сильному отличию фактических величин этих характеристик от табличных.
Поэтому выбор типа подобных характеристик и их значений оказывается своего рода искусством, в методах которого так много от интуиции человека-творца.
«Биологически активные вещества»,
Г.М.Баренбойм, А.Г.Маленков