22 ноября 2012

Конформационный фактор

Конформационный фактор наиболее благоприятен для прочности комплекса стероид — рецептор в том случае, если отображение атома О(L) стероида расположится в области соответствующих атомов наиболее активных соединений. По мере удаления атома от указанной области сродство стероида к рецептору будет падать. На рисунке ниже показано такое отображение.


Нелинейное отображение пространственного расположения атомов О(L)
в конформациях В карденолидов, А буфадиенолидов и
их структурных аналогов после пространственного совмещения
их стероидных частей (Шамовский и др., 1983)

Нелинейное отображение пространственного расположения атомов О(L) в конформациях В карденолидов, А буфадиенолидов и их структурных аналогов после пространственного совмещения их стероидных частей (Шамовский и др., 1983)

а — карденолиды, б — буфадиенолиды; в — биологически активные аналоги; г — неактивные соединения; д — сконструированные стероиды с неизвестной активностью. Пунктиром выделена область наиболее активных соединений: 1 — дигитоксигенин; 2 — дигоксигенин; 3 — гитоксигенин; 4 — сарментогенин; 5 — периплогенин; 6 — строфантидин; 7 — десарогенин; 8 — канногенин; 9 — строфантидол; 10 — сармутогенин; 11 — каудогенин; 12 — синогенин; 13 — бипиндогенин; 14 — сарверогенин; 15 — 4,5-β-эпоксидигитоксигенин; 16 — 4,5α-эпоксидигитоксигенин; 17 — ксизмалогенин; 18 — Δ14-дигитоксигенин; 19 — канаригенин; 20 — Δ8 (14)-дигитоксигенин; 21 — 3-эпидигитоксигенин; 22 — 3-эписарментогенин; 23 — узаригенин; 24 — коротоксигенин; 25 — 14-дезоксидигитоксигенин; 26 — буфалин; 27 — геллибригенин; 28 — геллибригенол; 29 — сцилларенин; 30 — 3-эпибуфалин; 31 — актодигенин; 32 — (20R)-Зβ-окси-22-метилен-5β-карданолид; 33 — (20 )-3β-окси-22-метилен-5р-карданолид; 34 — (20S) -3β-окси-22-метилен-5р-кард-14-енолид; 35 — (20S) -3-окси-22-метилен-5р-кард-14-енолид; 36 — 17R-(З-оксопроп-1-енил)-3β, 1 4-диокси-14β-тестан; 37 — 17β-(2-мето-ксикарбонилэтенил)-3β, 14-диокси-14β-тестан; 38 — 17 β- (2-метоксикарбонил-2-метилэтенил)-3β, 14-диокси-14-р-тестан; 39 — 17β -(4-метоксикарбонилбут-1,3-диенил)-3β,14-диокси-14β-тестан; 40 — 3β, 14-диокси-14β-прегн-17(20)-ен-21, 16у-лактон; 41 — 17β-Н-дигитоксигенин; 42 — Δ16-дигитоксигенин; 43 — адинеригенин; 44 — (20S)-изодигитоксигенин; 45 — (20S)-изодигитоксигенин; 46 — 3β, 14-диокси-14β-тестан-17-он; 47 — Δ11-дигитоксигенин; 48 — 19-иордигитоксигенин; 49 — 18-нордигитоксигенин; 50 — 17β-(3-формилцик-лопента-1,3-диенил)-3β,14-диокси-14β-тестан; 51 — 17β- (2-оксобицикло [3,3,0] окта-1 (8),3,5-триен) -3β, 14-диокси-14β-тестан; 52 — 17β- (2-оксо-З-оксабицикло [4,3,0] нона-1 (9),4,6-триен-7-ил) -3β,14-диокси-14β-тестан; 53 — 17β- (2-оксо-5-оксабицикло [4,3,0] нона-1 (9),3,6-триен-7-ил)-3β, 14 — диокси-14β -тестан; 54 — 17β-(2-метоксикарбонилэтенил)-3β, 14-диокси-14β -тест-4-ен; 55 — 17β-(З-метоксикарбонилбут-1,3-диенил)-3β, 14-диокси-14β -тестан; 56 — 17β- (5-оксо-2,5-дигидрофуран-2-илиден)-3β, 14-диокси-14β -тестан; 57 — 17β-(4-оксоциклогепт-1,2,5-триенил)-3β, 14-диокси-14β -тестан; 58 — 17β — (5-формилфуран-З-ил) -Зβ, 14-диокси-14β -тестан; 59 — 17β -(4-формилфуран-2-ил)-3β, 14-диокси-14β -тестан; 60 — 17β -(2-оксо-5,10-диоксабицикло [3,3,0] дека-1 (6),3,7-триен-8-ил)-Зβ,14-диокси-14β -тестан; 61 — 17β -(4-оксо-2,3-бенз-4-пиран-7-ил)-3β, 14-диокси-14β-тестан; 62 — 17β -(2-оксо-3-метилиден-2,3-дигидро-4-пиран-4-илиден) -3β, 14-диокси-14β-тестан.



«Биологически активные вещества»,
Г.М.Баренбойм, А.Г.Маленков



Все тестируемые ХС проходят регистрацию и определение степени новизны, а также прогностическое установление типа потенциальной биологической (фармакологической) активности расчетными методами структурно-информационного анализа. На этом основании для веществ с невысокими значениями Q, L и М определяется та выборка тестов, через которую они должны пройти. В ряде случаев эта выборка определяется по формализованным правилам, в большинстве случаев…

В итоговом документе («Биологический паспорт»), который формируется по итогам классификации данного ХС в автоматизированной системе, излагаются цели испытаний, а также следующие сведения о тестированном ХС: исходная информация о ХС (структурная и брутто-формула, физико-химические характеристики, организация-производитель, исходное назначение); номер регистрации; степень подлинности (соответствие структур, чистота); результаты испытаний с использованием расчетных методов; оценка биологической активности и токсичных…

Можно представить схему, изображенную на рисунке ниже, в более сжатой конспективной форме, развернув все события вдоль оси времени. Смотрите рисунок — Генеральная конфигурация системы классификации ХС Такая линейная развертка событий представлена на рисунке ниже, а комментарий к ней содержится в таблице, которую можно рассматривать как расширенную подпись к этому рисунку. Смотрите рисунок — Последовательность основных…

Вся работа системы проводится в интерактивном режиме: специфика работы с биологическим тест-объектом такова, что весьма высока вероятность его отклонения от стандарта в процессе подготовки эксперимента, резкого изменения его состояния или даже гибели в процессе эксперимента и т. д. Возможны ситуации, когда результаты тестирования ХС по одной методике могут привести к изменению всего порядка последующих испытаний…

Карта информационной биотехнологии и технических средств (часть 6)

Блок 9. классификация ХС по ихспособности сенсибилизировать биологические объекты к действию Функциональное назначение Определить изменение чувствительности биологических объектов при действии на них ХС по отношению к стандартному физическому фактору (нагревание, световое облучение и другие факторы в зависимости от задачи). Знание таких характеристик позволяет: 1) прогнозировать результат комбинированного действия ХС и физфактора; 2) выявить действие ХС,…