Фасет В и С
Фасет В содержит 330 дескрипторов, описывающих фармакологическую (фактически биологическую) активность ХС на молекулярном уровне взаимодействия с ферментами или с такими биорегуляторами, как гормоны, витамины и т. д.
Фасет С отражает данные о тропности действия ХС и содержит 184 дескриптора (для всех дескрипторов фасета С предполагается, что они в списке как бы стоят в конце фразы: «ХС, действующие на…»):
Антиметаболиты | В.З |
Антиметаболиты обмена аминокислотного | В.З. 1 |
Антихолинергические | В.4 |
Антихолинергические конкурентные | В.4.1 |
Геминоподобные | В.4.1.1 |
Холинолитики | В.4.1.2 |
Холинолитики | М В.4.1.2.1 |
Тиаминов антагонисты | В.5 |
Гормонов антагонисты | В.8 |
Интерфероногены | В.11 |
Комплексообразующие | В. 12 |
Коферменты | В. 13 |
Трансфераз ингибиторы | В.13.6 |
Стрихниноподобные (по действию) | В.26 |
Окончания нервов афферентных | С.1 |
Окончания нервов афферентных кожи | С. 1.1 |
Вирион | С.З |
Оболочка вириона | С.З.1 |
Гладкая мускулатура | С.5 |
Гладкая мускулатура артерий | С.5.1 |
Гладкая мускулатура артерий внутренних органов | С.7.11 |
Грибки | С.7 |
Гифы | С.7.1 |
Клеточная оболочка грибков | С.7.2 |
Железы эндокринные | С.9 |
Железы половые | С.9.5 |
Яичники | С.9.5.2 |
Фолликулы | С.9.5.2.1 |
Мозг головной | С.24 |
Кора больших полушарий | С.24.1 |
Большая часть дескрипторов относится к модели организма, но некоторые из них — к модели клетки и биосферы. В общем случае активность соединения записывается фасетной формулой, т. е. тремя дескрипторами — по одному из каждого фасета; при этом в рамках одной фасетной формулы дескрипторы фасетов В и С уточняют и конкретизируют информацию, выраженную дескриптором фасета А. Это положение иллюстрируется рисунке ниже на примере лекарства ипразида.
Фасетное описание ипразида
Общие количественные характеристики тезауруса представлены в таблице ниже.
Количественные характеристики тезауруса по фармакологическому действию химических соединений
Показатель | Обозначение | Численное значение | Характеристика |
1 | 2 | 3 | 4 |
Общее число терминов | V | 1916 | Число слов и словосочетаний, переводимых на ИПЯ |
Общее число дескрипторов | di | 712 | Число слов и словосочетаний, используемых для индексирования |
в фасете А («эффект») | dAi | 218 | — |
в фасете В («механизм») | dBi | 308 | — |
в фасете С («анатомическое место действия») | dCi | 186 | — |
Число недескрипторов | M1 = V — di | 1204 | Число терминов, всегда заменяемых на дескрипторы |
Коэффициент синонимии | γ = M1/V | 0,69 | Развитость входного словаря тезауруса и его способность к распознаванию синонимов |
Число дескрипторов без связей | M2 | 118 | Число дескрипторов I уровня, не имеющих видовых дескрипторов |
фасет А | — | 77 | — |
фасет В | — | 12 | — |
фасет С | — | 29 | — |
Число дескрипторов родоначальных | M3 | 53 | Число дескрипторов I уровня, имеющих видовые дескрипторы |
фасет А | — | 16 | — |
фасет В | — | 16 | — |
фасет С | — | 21 | — |
Число дескрипторов видовых | M4-6 | 541 | — |
фасет А | — | 125 | — |
фасет В | — | 280 | — |
фасет С | — | 136 | — |
Коэффициент иерархии | J=М2+M3+M4-6/М2+M3 | 4,16 | Степень разветвленности иерархии тезауруса |
фасет А | — | 2,30 | — |
фасет В | — | 11,00 | — |
фасет С | — | 3,70 | — |
Язык дескрипторов отражает сегодняшний уровень знаний. Главным ограничением для включения новых или более детальных дескрипторов в каждый из фасетов является отсутствие известных веществ с соответствующим видом биологической активности. Языки фасетов А, В, С открытые, они должны и могут развиваться по мере накопления знаний о фармакологической активности, механизме действия, тропности.
В настоящее время структурно-информационный анализ не классифицирует ХС в терминах языка ОВБА. Причина этого — явная недостаточность систематических знаний о влиянии лекарственных веществ на клеточно-тканевом уровне.
Этот пробел может быть естественно устранен при работе автоматизированной системы классификации ХС или ее достаточно производительного макета в режиме обратного скрининга.
Выполнение этой работы (объем ее около 7 — 10 тыс. ХС) позволит использовать структурно-информационный анализ для классификации ХС на языке ОВБА, поможет систематизировать результаты экспериментальных испытаний для определения вида биологической активности и выявить корреляции между биологическим и фармакологическим видами активности с указанием тканевой и (или) видовой тропности.
«Биологически активные вещества»,
Г.М.Баренбойм, А.Г.Маленков
Все тестируемые ХС проходят регистрацию и определение степени новизны, а также прогностическое установление типа потенциальной биологической (фармакологической) активности расчетными методами структурно-информационного анализа. На этом основании для веществ с невысокими значениями Q, L и М определяется та выборка тестов, через которую они должны пройти. В ряде случаев эта выборка определяется по формализованным правилам, в большинстве случаев…
В итоговом документе («Биологический паспорт»), который формируется по итогам классификации данного ХС в автоматизированной системе, излагаются цели испытаний, а также следующие сведения о тестированном ХС: исходная информация о ХС (структурная и брутто-формула, физико-химические характеристики, организация-производитель, исходное назначение); номер регистрации; степень подлинности (соответствие структур, чистота); результаты испытаний с использованием расчетных методов; оценка биологической активности и токсичных…
Можно представить схему, изображенную на рисунке ниже, в более сжатой конспективной форме, развернув все события вдоль оси времени. Смотрите рисунок — Генеральная конфигурация системы классификации ХС Такая линейная развертка событий представлена на рисунке ниже, а комментарий к ней содержится в таблице, которую можно рассматривать как расширенную подпись к этому рисунку. Смотрите рисунок — Последовательность основных…
Вся работа системы проводится в интерактивном режиме: специфика работы с биологическим тест-объектом такова, что весьма высока вероятность его отклонения от стандарта в процессе подготовки эксперимента, резкого изменения его состояния или даже гибели в процессе эксперимента и т. д. Возможны ситуации, когда результаты тестирования ХС по одной методике могут привести к изменению всего порядка последующих испытаний…
Блок 9. классификация ХС по ихспособности сенсибилизировать биологические объекты к действию Функциональное назначение Определить изменение чувствительности биологических объектов при действии на них ХС по отношению к стандартному физическому фактору (нагревание, световое облучение и другие факторы в зависимости от задачи). Знание таких характеристик позволяет: 1) прогнозировать результат комбинированного действия ХС и физфактора; 2) выявить действие ХС,…